14.1 Aminohappojen rakenne
Proteiineissa tavataan 20 erilaista aminohappoa, jotka kaikki ovat a-aminohappoja, eli aminoryhmä on kiinnittynyt karboksyyliryhmän viereiseen a-hiileen. Kaikissa muissa luonnon aminohapoissa, paitsi proliinissa, jossa R-ryhmä muodostaa renkaan aminoryhmän kanssa, on primäärinen aminoryhmä, RNH2, ja aminohapot eroavat toisistaan a-hiilessä olevan sivuketjun perusteella.
Luonnon aminohapot ovat optisesti aktiivisia, yksinkertaisinta glysiiniä lukuunottamatta. Aminohapon stereokemia voidaan esittää Fischerin projektiokaaviolla, jossa karboksyyliryhmä on ylhäällä ja aminoryhmä on vasemmalla, kun kysymyksessä on luonnon L-aminohappo.
Aminohapot voidaan luokitella sivuketjun rakenteen mukaan neutraaleiksi, happamiksi tai emäksisiksi aminohapoiksi.
Oheisessa taulukossa on esitetty eräitä aminohappoja.
|
Neutraalit: |
||
|
Glysiini, Gly (G) pKa1 = 2.35, pKa2 = 9.78, pI = 6.06* |
Alaniini, Ala (A) pKa1 = 2.35, pKa2 = 9.87, pI = 6.11 |
|
|
Valiini, Val (V) pKa1 = 2.29, pKa2 = 9.72, pI = 6.00 |
Leusiini, Leu (L) pKa1 = 2.33, pKa2 = 9.74, pI = 6.04 |
|
|
Fenyylialaniini, Phe (F) pKa1 = 2.58, pKa2 = 9.24, pI = 5.91 |
Proliini, Pro (P) pKa1 = 2.00, pKa2 = 10.00, pI = 6.30 |
|
|
Pooliset |
||
|
Seriini, Ser (S) pKa1 = 2.21, pKa2 = 9.15, pI = 5.68 |
Kysteiini, Cys (C) pKa1 = 2.05, pKa2 = 10.25, pKa3= 8.00, pI = 5.02 |
|
|
Tyrosiini, Tyr (Y) pKa1 = 2.20, pKa2 = 9.11, pKa3 = 10.07, pI = 5.63 |
Asparagiini, Asn (N) pKa1 = 2.02, pKa2 = 8.80, pI = 5.41 |
|
|
Positiivisesti varautuneet |
||
|
Lysiini, Lys (K) pKa1 = 2.18, pKa2 = 8.95, pKa3 = 10.53, pI = 9.74 |
Histidiini, His (H) pKa1 = 1.77, pKa2 = 6.10, pKa3 = 9.18, pI = 7.64 |
|
|
Negatiivisesti varautuneet |
||
|
Asparagiinihappo, Asp (D) pKa1 = 2.10, pKa2 = 3.86, pKa3 = 9.82, pI = 2.98 |
Glutamiinihappo, Glu (E) pKa1 = 2.10, pKa2 = 4.07, pKa3 = 9.47, pI = 3.08 |
|
*pI = isoelektrinen piste, jossa pH:ssa aminohappo on täydellisesti kahtaisionimuodossa.
Katso myös: http://fi.wikipedia.org/wiki/Aminohapot
Tehtävä. 19:sta luonnon L-aminohapolla on S-konfiguraatio paitsi kysteiinillä, jolla on R-konfiguraatio. Selitä miksi? Vastaus
| Sisällysluettelo |
