Yliopiston laitosrakenne uudistui 1.1.2006. Lääketieteellisessä tiedekunnassa lakkautettiin aiemmat kaksikymmentäviisi laitosta ja klinikkaa ja niiden tilalle perustetaan kolme laitosta, biolääketieteen laitos, kliininen laitos sekä kansanterveystieteen ja kliinisen ravitsemustieteen laitos.