Biochemistry

Degrees Awarded in 2005

Degrees Awarded in 2006

Doctor of Philosophy

Hakulinen, Pasi Antero
Experimental studies on cellular mechanisms of the carcinogenicity of 3-chloro-4-(dichloromethyl)-5-hydroxy-2(5H)-furanone (MX) (main subject biotechnology) April 28, 2006 (supervisors: J. Mäki-Paakkanen, KTL; K. Servomaa, Pohj.Savon ympäristökeskus; H. Komulainen, KTL)

Koistinen, Kaisa Maria
Birch PR-10c : multifunctional binding protein (main subject biotechnology) January 27, 2006 (supervisors: S. Kärenlampi, A. Tervahauta, Institute of Applied Biotechnology)

Molnár, Ferdinand
Structural analysis of the ligand-binding domains of human and mouse CAR, human VDR and human PPARs (main subject biochemistry) March 31, 2006 (supervisors: C. Carlberg, Department of Biochemistry; P. Honkakoski, Department of Pharmaceutics)

Master of Science

Biochemistry Degree Program:

Ahonen, Henna Maarit
SFRP4 -geeni tyypin 2 diabeteksen kandidaattigeeninä/SFRP4 gene as a candidate gene for type 2 diabetes. May 22, 2006 (supervisors: M. Laakso, R. Miettinen, Kuopio University Hospital, R. Miettinen)

Hartikainen, Eino Samuel
Potentiaalisten diagnostisten merkkiproteiinien tunnistaminen Alzheimer-potilaiden seerumeista kaksisuuntaisen geelielektroforeesin avulla/Identification of potential diagnostic protein markers from serum of Alzheimer's disease patients by two dimensional gel electrophoresis. April 19, 2006 (supervisors: J. Ojala, Clinical Research Unit; S. Ryhänen, Department of Biochemistry; M. Korolainen, Department of Neurology, Res.)

Heloterä, Hanna Maria
VEGF:C:n rooli immuunivasteessa ja inflammaatiossa/ Role of VEGF-C in immune response and inflammation. Jan 20, 2006 (supervisors: K. Alitalo, M. Lohela, Biomedicum, Helsinki; A. Linnala-Kankkunen, Department of Biochemistry)

Hämäläinen, Maria Eveliina
Lentivirusvälitteinen transgeneesi hiirillä: Kudosspesifisen Tie1-promoottorin toiminta ja käyttö siirtogeenin
ilmentymisessä in vivo ja in vitro/ Lentivirus mediated transgenesis in mice:Function and use of tissue spesific Tie1 promoter in vivo and in vitro transgene expression (main subject biochemistry)
Sept. 29, 2006 (supervisors: A-M. Kärkkkäinen, A.I. Virtanen Institute, A. Linnala-Kankkunen, Department of Biochemistry)

Kananen, Tero Juhani
Plasman elektronegatiivisen LDL:n eristys ja karakterisointi/Isolation and characterization of electronegatively charged LDL in plasma (main subject biochemistry) May 31, 2006 (supervisors: K. Nyyssönen, KTTL; A. Linnala-Kankkunen, Department of Biochemistry)

Kauhanen, Miia Mariia
CD44:n ilmeneminen haavautetuissa keratinosyyteissä/Expression of CD44 in wounded keratinocytes cultures (main subject biochemistry) Oct. 3, 2006 (supervisors: R. Tammi, M. Tammi, Department of Anatomy; A. Linnala-Kankkunen, Department of Biochemistry)

Keronen, Linda Emilia
Verisuonen endoteelikasvutekijöiden tuottosysteemien optimointi hyönteissoluissa/Optimization of vascular endothelial growth factor product systems in insect cells (main subject biochemistry) Aug. 24, 2006 (supervisors: O. Laitinen, A.I. Virtanen Institute; S. Ryhänen, Department of Biochemistry)

Matilainen, Olli Juhani
Hiiren CAR-tumareseptorin ligandispesifisyys ja toimintamekanismi/Ligand specificity and function mechanism of mouse CAR nuclear receptor. Oct. 2, 2006 (supervisors: P. Honkakoski, Department of Pharmaceutical Chemistry; S. Väisänen, Department of Biochemistry)

Poutiainen, Sami
2-(sykloalkenyylikarbonyyli)-atsasyklo-yhdisteiden synteesien kehittäminen. Feb. 3, 2006 (supervisors: E. Jarho, Pharm. Chemistry; E, Wallén, University of Gothenburg, Sweden)

Pyykönen, Sanna-Maria
Marjojen fraktiointi ja tutkiminen Streptococcus pneumomoniae- ja Srteptococcus agalactiae-bakteereiden aiheuttamien infektioiden ehkäisyssä/Fractionation and anti-infective properties of berries against Streptococcus pneumoniae and Streptococcus agalactiae. Jan. 18, 2006 (supervisors: K. Tikkanen-Asikainen, Department of Pharmaceutical Chemistry; A. Linnala-Kankkunen, Department of Biochemistry)

Sonninen, Riitta Marjut Susanna
MikroRNA-mikrosirun suunnittelu ja valmistus/Design and production of a Caenorhabditis elegans microRNA microarray. Aug. 23, 2006 (supervisors: G. Wong, M. Storvik, Department of Biochemistry)

Sutinen, Päivi Maarit Johanna
Adenoviruksen VA1 RNA-välitteinen tyypin I IFN-vasteen vaimentaminen ihmisen syöpäsoluissa/Adenovirus VA1 RNA mediated type I interferon response suppression in human cancer cells (main subject biochemistry) Dec. 22, 2006 (supervisors: J. Wahlfors, R. Pellinen, A.I. Virtanen Institute; A. Linnala-Kankkunen, Department of Biochemistry)

Turunen, Mikko Markus
Kromatiinin silmukoituminen mahdollistaa kaukaisten D-vitamiiniresponsiivisten elementtien osallistumisen
CYP27B1 geenin 1a,25(OH)2D3 riippuvaiseen alassäätelyyn/Chromatin looping allows distal VDREs to support the negative VDRE in 1a,25(OH)2D3 - dependent down-regulation of the human CYP27B1 gene. Oct. 11, 2006 (supervisors: C. Carlberg, S. Väisänen, Department of Biochemistry)

Biochemistry and Biotechnology Degree Program:

Kärkkäinen, Jouni Ilari
D-vitamiinireseptorin ligandiin sitoutuvan domeenin molekyylidynamiikkasimulaatioita/Molecular dynamics simulations of the vitamin D receptor ligand binding domain complexed with ligands
ZK159222, ZK168281, and Gemini (main subject biochemistry) Dec. 29, 2006 (supervisors: M. Peräkylä, C. Carlberg, Department of Biochemistry)

Pimenoff, Ville Nikolai
Retrovirusvälitteinen ex vivo geeninsiirto New Zealand White-kanin verisuonen seinämään (main subject biotechnology) June 30, 2006 (supervisors: S. Ylä-Herttuala, A.I. Virtanen Institute)

Salo, Jarkko
Seerumin alkalisen fosfataasin isoentsyymit ja niiden elektroforeettiset määritysmenetelmät/Serum alkaline phosphatase isoentzymes and their electrophoretic determination methods (main subject biochemistry) Aug. 22, 2006 (supervisors: I. Penttilä, M. Parviainen, J. Herranen, Department of Clinical Chemistry, Kuopio University Hospital)